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溢流式过滤器：一般用于裸缸养大型鱼时采用(比如龙鱼、罗流鱼等)，此种过滤系统在理论上讲可以免维护，但仍然需要人工来清理鱼缸底部的废物。此种过滤系统的缺点就是不美观、体积较大!但其生化过滤系统效果!
外挂式过滤器 ：外观一般为盒状，通常自带有水泵，一般用于中小或小型鱼缸使用，因体其积小、水流强度不高、不会占用缸内空间。维护方面比较方便。能常商家叫这为瀑布式过滤系统，效果不太理想，但是袖珍美观，一般推荐10升以下的水族箱使用。
滴流与渗流： 滴流式过滤，这种过滤系统多用于溢流式过滤器或上部式滴流盒，其主要特征在于滤材大部份暴露天空气里，滤材主要以陶瓷环、生化球、过滤棉为过滤材质，进行生化过滤过程，过滤仓内有流动空气，但无物理过滤的功能。 渗流式过滤 ，滤材通常为滤棉、生化棉、底砂。主要的特征为滤材基本浸于水体之中，不与空气直接接触，起到物理过滤过程，但是在生化棉和底砂之间有较大的空隙，可为消化细菌提供良好的生存环境，也有一定的生化过滤能力。这两种过滤系统的过滤效果都很好，但也有缺点，滴流过滤需要在鱼缸上部占较大的一块空间，也不美观。
太小的缸，或没有条件添加除油膜硬件，可以放一些“黑玛莉”，这种上层鱼，总是在水面上找食物，同时吞食油膜。也可以定期用一个小杯子压入水中，杯口贴近水面，让水面的水溢流到杯中，手工清除油膜。